Tropes V8.4 avec export GEPHI /GEXF

8 juillet 2013 - Version finale (le premier prototype datait du 3 avril 2013)
Une mise à jour vers Tropes V8.4.2 est disponible depuis le 18 février 2014.
Une mise à jour vers Tropes V8.4.4 est disponible depuis le 28 juin 2014.

Tropes V8.4 est téléchargeable ici :
http://www.tropes.fr/download.htm

Ce premier article détaille les extensions Gephi/GEXF, pour la liste complète des nouveautés, voir ici :
https://tropes.forumactif.fr/t69-tropes-v84-avec-export-gephi-gexf#253

Gephi est un logiciel Open source de visualisation de données structurées. Tropes 8.4 exporte des fichiers GEXF (Graphic Exchange XML format, cf. http://gexf.net), compatibles avec Gephi. Vous allez donc pouvoir traiter et "spatialiser" vos scénarios pour produire pour des graphes comme celui-ci :



Ce graphe résulte des textes d’exemple de Madame Bovary de Flaubert, livrés avec Tropes.

Mode d’emploi

1. Vous devez au préalable installer Gephi, qui est librement téléchargeable ici : http://www.gephi.org
   
2. Installez Tropes V8.4, dans la langue qui vous convient, en prenant le soin de sauvegarder vos scénarios avant toutes choses (comme d’habitude).
   
3. Analysez un ou plusieurs textes avec Tropes V8.4, puis utilisez le menu [Outils][Exports GEXF]. Vous devez choisir un dossier en sortie et appuyer sur le bouton [Exporter].
   
4. Le traitement peut prendre un certain temps, surtout si vous avez un gros scénario, patientez...
   
5. Si vous avez coché l’option [Afficher le résultat] alors Gephi se lance automatiquement sur le fichier des relations de Tropes en fin de processus.
   

Fichiers GEXF en sortie

Dans l’immédiat, trois fichiers exportés sont opérationnels :
1 - TropesRelations.gexf (matrices des relations de votre scénario).
2 - TropesOntology.gexf (cooccurrences entre documents et éléments du Scénario)
3 - TropesMatrix.gexf  (matrices des documents de votre scénario).

Les deux derniers fichiers ne sont exploitables que si vous analysez plusieurs documents.

D’autres exports suivront, en particulier pour les catégories de Tropes qui sont absentes de ce premier prototype.

Si vous utilisez les scénarios [Concepts xx], installé par défaut avec Tropes, avec une série de fichiers, alors les matrices peuvent être énormes. Il est donc conseillé de cocher l’option [Réduction automatique des données] dans l’export GEXF de Tropes, pour éviter de saturer Gephi et la mémoire de votre ordinateur. Ou bien vous utiliserez un scénario épuré, concentré sur ce que vous voulez visualiser, ce qui est méthodologiquement plus acceptable.

Pour finir, je vais avoir besoin de temps pour finaliser cette nouvelle version 8.4 de Tropes. Elle ne sera pas disponible en version définitive avant le mois de juin.

A vous de me dire...

Pierre

Edité plusieurs fois (en fonction de évolutions)

Gephi est un logiciel un peu complexe, mais vous pouvez arriver à produire un graphe en quelques minutes.

Voici une méthode pour réaliser votre première visualisation :

1. Ouvrez un fichier GEXF (DynamicRelations, DynamicOntology ou DynamicMatrix) avec Gephi.
   
2. Fermez la fenêtre "Accueil - Bienvenue dans Gephi". Ne vous souciez pas de l'affichage en cours... Cliquez sur l'onglet [Vue d'ensemble] (en haut de l'écran).
   
3. Cliquez sur [Choisir une spatialisation], puis choisissez [Force Atlas] (cadre en bas à gauche).
   
4. Mettez une valeur de 4000 (au minimum) dans le paramètre [Force de répulsion].
   
5. Appuyez sur le bouton [Exécuter] puis patientez une minute, avant d'appuyer sur [Arrêter].  
   
6. Cliquez sur l'onglet [Prévisualisation] (en haut de l'écran).
   
7. Cochez la case [Afficher les labels] (dans le cadre de gauche).
   
8. Appuyez sur le bouton [Rafraîchir] (en bas).
   

Et voilà, vous avez réalisé votre premier graphe Gephi.

Si vous connaissez la langue de Shakespeare, lisez ce guide d'utilisation :
https://gephi.org/users/quick-start/

16/5/2013 - Tropes V8.4 Beta

Evolution des exports GEPHI/GEXF :
- ajout d'un troisième format d'export (cooccurrence entre les documents et le scénario, voir l'exemple ci-dessous) ;
- les fichiers en sortie changent de nom (ils s'appellent TropesXXX) ;
- changement de logique de nommage des Id des Nodes des documents ;
- amélioration de la compression de matrices.

Modifications autres que les exports GEPHI/GEXF :
- affichage (optionnel) des noms de fichiers dans les extraits de texte ;
- ouverture de l'intégralité des fichiers d'un dossier ;
- historique des dossiers récemment ouverts ;
- le drag & drop d'un dossier ouvre la liste des fichiers correspondants ;
- affichage de la concentration de relations dans le graphe des acteurs ;
- fonction [Dissocier] plus rapide dans l'outil Scénario ;
- changement d'image pour les groupes invisibles ;
- légère amélioration des performances globales ;
- rationalisation des menus [Aide] ;
- bulles contextuelles (Hint) plus explicites ;
- mises à jour des dictionnaires et scénarios par défaut.

Le manuel de référence de Tropes français a été mis à jour. La version online est ici :
http://www.tropes.fr/ManuelDeTropesV840.pdf

Vous devez désinstaller l'ancienne version 8.4 de Tropes avant d'installer celle-ci.

Pensez à sauvegarder vos scénarios, comme d'habitude, avant d'installer la mise à jour.

S'il n'y a pas de problème signalé, la version définitive sortira dans un mois.

Cordialement,
Pierre

Voici un exemple de graphe Gephi utilisant les sorties GEXF TropesOntology, avec les discours de politique générale des Premiers ministres de la Ve République :



La version PDF du graphe ci-dessus est téléchargeable ici :
http://www.tropes.fr/img/CorpusPremiersMinistresPersonnalitesv3.pdf

Ce résultat a été obtenu en définissant un Scénario spécifique des principaux noms propres utilisés par les Premiers ministres. Notez que les fichiers du corpus sont affichés avec une majuscule, alors que les concepts sont toujours en minuscule. On sait donc qui a parlé de quoi.

Merci beaucoup à Pascal Marchand d'avoir fourni ce corpus.

Pour plus d'information sur ces textes, ou à propos de Pascal, consultez :
http://pascal-marchand.fr/spip.php?rubrique1

Même si ce n'est pas une révolution, le fait d'afficher simultanément les noms des documents et les concepts du Scénario, sur le même graphe, est une réelle évolution de la visualisation des résultats de Tropes. Cependant ce type de graphe implique des contraintes : il faut limiter le nombre de concepts, en réduisant temporairement le Scénario, par exemple en sélectionnant une branche, pour éclaircir les résultats.

A vous de juger !

Identification d'un bug dans Tropes V8.4 BETA - 10 juin 2013

Description :
Quand Tropes rencontre une série de 128 mots contenant des signes de ponctuation ambigus, l'assemblage des mots composés ne se fait pas sur le 128ème mot de la série.

Considérant que le point "." fait partie des signes ambigus, ce bug est rare mais reproductible sur de nombreux corpus. Notez que le point est utilisé comme séparateur des URL internet (www.tropes.fr) et dans les nombres (par exemple 1.000,00). Il nécessite donc un traitement spécifique.

Conséquence :
Tropes n'identifie pas certains mots composés.

Si ce problème doit être considéré comme négligeable sur les gros documents, il peut toutefois - sur certains textes - faire varier la levée d’ambiguïté sémantique. Par exemple, sur "Madame Bovary" de Flaubert (112 000 occurrences), cette erreur qui arrive d'une façon "homéopathique" modifie les résultats de 0,02%

Correction du problème :
Mise à jour de l'analyse morphosyntaxique, qui gère mieux les espaces après les points.

Ce correctif sera disponible dans la version définitive de Tropes (c'est-à-dire probablement dans deux semaines).

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Merci à Jean d'avoir signalé ce bug, très difficile à détecter.

S'il y a d'autres problèmes, il faut m'en parler rapidement.

Pierre

8 juillet 2013 - Tropes V8.4 est disponible en version finale, en langues française et anglaise à l'adresse habituelle ( www.tropes.fr ).

Cette version corrige le problème signalé ci-dessus et intègre une évolution des dictionnaires et scénarios par défaut.

Pensez à désinstaller les anciennes versions de Tropes, si vous faites une mise à jour.

Une sauvegarde de vos scénarios est toujours nécessaire, pensez-y régulièrement.

Bonnes vacances à tous,
Pierre

Bonjour,

Je découvre avec intérêt avec la version 8.4 de Tropes (merci à leurs auteurs !) la possibilité d'exporter des données analysées avec Tropes sous forme de carte avec représentation visuelle des co-occurrences de termes générée par Gephi.
Je suis particulièrement intéressée par l'analyse et la représentation cartographique (de type Gephi) de co-occurrence de mots-clés (ou catégories-matières o udisciplibaires) dans une liste de références bibliographiques.
Pourriez-vous me conseiller et décrire un itinéraire technique le plus efficient possible pour à la fois :
- préparer mon fichier source (ensemble de références bibliographiques successives constituées de plusieurs champs : auteurs, affiliations, titre du document, source de publication, catégories-matières, mots-clés,...) afin qu'il soit exploitable par Tropes ;
- conduire l'analyse de ce fichier sous Tropes ;
- exporter et visualiser les co-occurrences de termes entre références bibliographiques (par exemple co-occurrence de catégories-matières, d'organismes affiliations, de pays d'auteurs, ...).

Merci d'avance pour vos conseils méthodologiques et techniques qui me permettront d'avancer dans le champ de plus en plus investi et exigent de l'analyse bibliométrique sur la base d'un corpus bibliographique.

Bonjour Marie-Claude,

Je suis content que cette nouvelle version vous plaise.

Les réponses à vos questions vont déborder largement du cadre de ce topic.

Je vous appelle.

Cordialement,
Pierre

Bonjour à tous,

Tropes V8.4.2 est disponible depuis le 18 février 2014, à l'adresse habituelle :
http://www.tropes.fr/download.htm

Cette mise à jour comporte une évolution des dictionnaires (liée à l'actualité) et corrige un bug mineur (problème de placement de l'Outil Scénario dans les configurations multi-écran).

Vous devez absolument désinstaller les anciennes version 8.4 de Tropes avant d'installer celle-ci.

Pensez à sauvegarder vos scénarios, comme d'habitude, avant d'installer la mise à jour.

Cordialement,
Pierre

Bonjour à tous,

Tropes V8.4.2 Rev A. est disponible depuis le 17 mars 2014, à l'adresse habituelle :
http://www.tropes.fr/download.htm

Cette mise à jour comporte une nouvelle évolution des dictionnaires (liée à l'actualité) en langue française.

Vous devez absolument désinstaller les anciennes version 8.4 de Tropes avant d'installer celle-ci.

Pensez à sauvegarder vos scénarios, comme d'habitude, avant d'installer la mise à jour.

Sinon j'ai rédigé un premier guide d'utilisation de Tropes avec Gephi. Consultable ici :
http://www.tropes.fr/UtiliserGephiavecTropesVF84.pdf

Il reste encore beaucoup de choses à dire sur l'utilisation de Tropes avec Gephi. J'espère que certains d'entre vous prendront le relais ;-)

Cordialement,
Pierre

Bonjour à tous,

Tropes V8.4.4 est disponible depuis le 28 juin 2014, à l'adresse habituelle :
http://www.tropes.fr/download.htm

Cette mise à jour contient :
- une évolution des dictionnaires (liée à l'actualité) ;
- une amélioration du dialogue Copier > Texte (qui affiche le contexte) ;
- une modification de l'entête des fichiers GEXF (qui évoluent en V1.1) ;
- quelques changements mineurs dans l'analyse morphosyntaxique.

Vous devez absolument désinstaller les anciennes version 8.4 de Tropes avant d'installer celle-ci.

Pensez à sauvegarder vos scénarios, comme d'habitude, avant d'installer la mise à jour.

Cordialement,
Pierre

Bonjour à tous,

Tropes V8.4.5 est disponible depuis le 17 septembre 2014, à l'adresse habituelle :
http://www.tropes.fr/download.htm

Cette mise à jour contient uniquement une évolution des dictionnaires (liée à l'actualité).

Vous devez absolument désinstaller les anciennes version 8.4 de Tropes avant d'installer celle-ci.

Pensez à sauvegarder vos scénarios, comme d'habitude, avant d'installer la mise à jour.

Si vous n'avez pas besoin de suivre l'actualité, cette petite évolution n'est pas indispensable. Vous pouvez attendre patiemment la prochaine cuvée...

Cordialement,
Pierre

Bonjour Pierre, MErci pour le boulot. Il me reste des ultimes tests pour voir si les scripts R fonctionne pour l'export en matrice tableau x concept. 9a marchait sous linux, ça marche sur mon windows 8, je dois tester dans les très prochains jours sur différents PC pour m'assurer que les exports peuvnt se faire moyennant juste 1 ou deux clics.

A bientôt

Brice

Pierre a écrit:Bonjour à tous,

Tropes V8.4.5 est disponible depuis le 17 septembre 2014, à l'adresse habituelle :
http://www.tropes.fr/download.htm

Cette mise à jour contient uniquement une évolution des dictionnaires (liée à l'actualité).

Vous devez absolument désinstaller les anciennes version 8.4 de Tropes avant d'installer celle-ci.

Pensez à sauvegarder vos scénarios, comme d'habitude, avant d'installer la mise à jour.

Si vous n'avez pas besoin de suivre l'actualité, cette petite évolution n'est pas indispensable. Vous pouvez attendre patiemment la prochaine cuvée...

Cordialement,
Pierre